International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways

Cordell, H. J.; Han, Y.; Mells, G. F.; Li, Y.; Hirschfield, G. M.; Greene, C. S.; Xie, G.; Juran, B. D.; Zhu, D.; Qian, D. C.; Floyd, J. A. B.; Morley, K. I.; Prati, D.; Lleo, A.; Cusi, D.; Gershwin, M. E.; Anderson, C. A.; Lazaridis, K. N.; Invernizzi, P.; Seldin, M. F.; Sandford, R. N.; Amos, C. I.; Siminovitch, K. A.; Schlicht, E. M.; Lammert, C.; Atkinson, E. J.; Chan, L. L.; De Andrade, M.; Balschun, T.; Mason, A. L.; Myers, R. P.; Zhang, J.; Milkiewicz, P.; Qu, J.; Odin, J. A.; Luketic, V. A.; Bacon, B. R.; Bodenheimer, H. C.; Liakina, V.; Vincent, C.; Levy, C.; Gregersen, P. K.; Almasio, P. L.; Alvaro, D.; Andreone, P.; Andriulli, A.; Barlassina, C.; Battezzati, P. M.; Benedetti, A.; Bernuzzi, F.; Bianchi, I.; Bragazzi, M. C.; Brunetto, M.; Bruno, S.; Casella, G.; Coco, B.; Colli, A.; Colombo, M.; Colombo, S.; Cursaro, C.; Croce, L. S.; Crosignani, A.; Donato, M. F.; Elia, G.; Fabris, L.; Ferrari, C.; Floreani, A.; Foglieni, B.; Fontana, R.; Galli, A.; Lazzari, R.; Macaluso, F.; Malinverno, F.; Marra, F.; Marzioni, M.; Mattalia, A.; Montanari, R.; Morini, L.; Morisco, F.; Mousa Hani, S.; Muratori, L.; Muratori, P.; Niro, G. A.; Palmieri, V. O.; Picciotto, A.; Podda, M.; Portincasa, P.; Ronca, V.; Rosina, F.; Rossi, S.; Sogno, I.; Spinzi, G.; Spreafico, M.; Strazzabosco, M.; Tarallo, S.; Tarocchi, M.; Tiribelli, C.; Toniutto, P.; Vinci, M.; Zuin, M.; Ch'Ng, C. L.; Rahman, M.; Yapp, T.; Sturgess, R.; Healey, C.; Czajkowski, M.; Gunasekera, A.; Gyawali, P.; Premchand, P.; Kapur, K.; Marley, R.; Foster, G.; Watson, A.; Dias, A.; Subhani, J.; Harvey, R.; Mccorry, R.; Ramanaden, D.; Gasem, J.; Evans, R.; Mathialahan, T.; Shorrock, C.; Lipscomb, G.; Southern, P.; Tibble, J.; Gorard, D.; Palegwala, A.; Jones, S.; Carbone, M.; Dawwas, M.; Alexander, G.; Dolwani, S.; Prince, M.; Foxton, M.; Elphick, D.; Mitchison, H.; Gooding, I.; Karmo, M.; Saksena, S.; Mendall, M.; Patel, M.; Ede, R.; Austin, A.; Sayer, J.; Hankey, L.; Hovell, C.; Fisher, N.; Carter, M.; Koss, K.; Piotrowicz, A.; Grimley, C.; Neal, D.; Lim, G.; Levi, S.; Ala, A.; Broad, A.; Saeed, A.; Wood, G.; Brown, J.; Wilkinson, M.; Gordon, H.; Ramage, J.; Ridpath, J.; Ngatchu, T.; Grover, B.; Shaukat, S.; Shidrawi, R.; Abouda, G.; Ali, F.; Rees, I.; Salam, I.; Narain, M.; Brown, A.; Taylor-Robinson, S.; Williams, S.; Grellier, L.; Banim, P.; Das, D.; Chilton, A.; Heneghan, M.; Curtis, H.; Gess, M.; Drake, I.; Aldersley, M.; Davies, M.; Jones, R.; Mcnair, A.; Srirajaskanthan, R.; Pitcher, M.; Sen, S.; Bird, G.; Barnardo, A.; Kitchen, P.; Yoong, K.; Chirag, O.; Sivaramakrishnan, N.; Macfaul, G.; Jones, D.; Shah, A.; Evans, C.; Saha, S.; Pollock, K.; Bramley, P.; Mukhopadhya, A.; Fraser, A.; Mills, P.; Shallcross, C.; Campbell, S.; Bathgate, A.; Shepherd, A.; Dillon, J.; Rushbrook, S.; Przemioslo, R.; Macdonald, C.; Metcalf, J.; Shmueli, U.; Davis, A.; Naqvi, A.; Lee, T.; Stephen, D.; Collier, J.; Klass, H.; Ninkovic, M.; Cramp, M.; Sharer, N.; Aspinall, R.; Goggin, P.; Ghosh, D.; Douds, A.; Hoeroldt, B.; Booth, J.; Williams, E.; Hussaini, H.; Stableforth, W.; Ayres, R.; Thorburn, D.; Marshall, E.; Burroughs, A.; Mann, S.; Lombard, M.; Richardson, P.; Patanwala, I.; Maltby, J.; Brookes, M.; Mathew, R.; Vyas, S.; Singhal, S.; Gleeson, D.; Misra, S.; Butterworth, J.; George, K.; Harding, T.; Douglass, A.; Panter, S.; Shearman, J.; Bray, G.; Butcher, G.; Forton, D.; Mclindon, J.; Cowan, M.; Whatley, G.; Mandal, A.; Gupta, H.; Sanghi, P.; Jain, S.; Pereira, S.; Prasad, G.; Watts, G.; Wright, M.; Neuberger, J.; Gordon, F.; Unitt, E.; Grant, A.; Delahooke, T.; Higham, A.; Brind, A.; Cox, M.; Ramakrishnan, S.; King, A.; Collins, C.; Whalley, S.; Li, A.; Fraser, J.; Bell, A.; Wong, V. S.; Singhal, A.; Gee, I.; Ang, Y.; Ransford, R.; Gotto, J.; Millson, C.; Bowles, J.; Thomas, C.; Harrison, M.; Galaska, R.; Kendall, J.; Whiteman, J.; Lawlor, C.; Gray, C.; Elliott, K.; Mulvaney-Jones, C.; Hobson, L.; Van Duyvenvoorde, G.; Loftus, A.; Seward, K.; Penn, R.; Maiden, J.; Damant, R.; Hails, J.; Cloudsdale, R.; Silvestre, V.; Glenn, S.; Dungca, E.; Wheatley, N.; Doyle, H.; Kent, M.; Hamilton, C.; Braim, D.; Wooldridge, H.; Abrahams, R.; Paton, A.; Lancaster, N.; Gibbins, A.; Hogben, K.; Desousa, P.; Muscariu, F.; Musselwhite, J.; Mckay, A.; Tan, L.; Foale, C.; Brighton, J.; Flahive, K.; Nambela, E.; Townshend, P.; Ford, C.; Holder, S.; Palmer, C.; Featherstone, J.; Nasseri, M.; Sadeghian, J.; Williams, B.; Thomas, C.; Rolls, S. -A.; Hynes, A.; Duggan, C.; Jones, S.; Crossey, M.; Stansfield, G.; Macnicol, C.; Wilkins, J.; Wilhelmsen, E.; Raymode, P.; Lee, H. -J.; Durant, E.; Bishop, R.; Ncube, N.; Tripoli, S.; Casey, R.; Cowley, C.; Miller, R.; Houghton, K.; Ducker, S.; Wright, F.; Bird, B.; Baxter, G.; Keggans, J.; Hughes, M.; Grieve, E.; Young, K.; Williams, D.; Ocker, K.; Hines, F.; Martin, K.; Innes, C.; Valliani, T.; Fairlamb, H.; Thornthwaite, S.; Eastick, A.; Tanqueray, E.; Morrison, J.; Holbrook, B.; Browning, J.; Walker, K.; Congreave, S.; Verheyden, J.; Slininger, S.; Stafford, L.; O'Donnell, D.; Ainsworth, M.; Lord, S.; Kent, L.; March, L.; Dickson, C.; Simpson, D.; Longhurst, B.; Hayes, M.; Shpuza, E.; White, N.; Besley, S.; Pearson, S.; Wright, A.; Jones, L.; Gunter, E.; Dewhurst, H.; Fouracres, A.; Farrington, L.; Graves, L.; Marriott, S.; Leoni, M.; Tyrer, D.; Martin, K.; Dali-Kemmery, L.; Lambourne, V.; Green, M.; Sirdefield, D.; Amor, K.; Colley, J.; Shinder, B.; Jones, J.; Mills, M.; Carnahan, M.; Taylor, N.; Boulton, K.; Tregonning, J.; Brown, C.; Clifford, G.; Archer, E.; Hamilton, M.; Curtis, J.; Shewan, T.; Walsh, S.; Warner, K.; Netherton, K.; Mupudzi, M.; Gunson, B.; Gitahi, J.; Gocher, D.; Batham, S.; Pateman, H.; Desmennu, S.; Conder, J.; Clement, D.; Gallagher, S.; Orpe, J.; Chan, P.; Currie, L.; O'Donohoe, L.; Oblak, M.; Morgan, L.; Quinn, M.; Amey, I.; Baird, Y.; Cotterill, D.; Cumlat, L.; Winter, L.; Greer, S.; Spurdle, K.; Allison, J.; Dyer, S.; Sweeting, H.; Kordula, J.

doi:10.1038/ncomms9019

Primary biliary cirrhosis (PBC) is a classical autoimmune liver disease for which effective immunomodulatory therapy is lacking. Here we perform meta-analyses of discovery data sets from genome-wide association studies of European subjects (n=2,764 cases and 10,475 controls) followed by validation genotyping in an independent cohort (n=3,716 cases and 4,261 controls). We discover and validate six previously unknown risk loci for PBC (Pcombined <5 × 10-8) and used pathway analysis to identify JAK-STAT/IL12/IL27 signalling and cytokine-cytokine pathways, for which relevant therapies exist.