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Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic inflammatory disorder with poorly defined aetiology characterised by synovial inflammation with variable disease severity and drug responsiveness. To investigate the peripheral blood immune cell landscape of early, drug naive RA, we performed comprehensive clinical and molecular profiling of 267 RA patients and 52 healthy vaccine recipients for up to 18 months to establish a high quality sample biobank including plasma, serum, peripheral blood cells, urine, genomic DNA, RNA from whole blood, lymphocyte and monocyte subsets. We have performed extensive multi-omic immune phenotyping, including genomic, metabolomic, proteomic, transcriptomic and autoantibody profiling. We anticipate that these detailed clinical and molecular data will serve as a fundamental resource offering insights into immune-mediated disease pathogenesis, progression and therapeutic response, ultimately contributing to the development and application of targeted therapies for RA.
RA-MAP, molecular immunological landscapes in early rheumatoid arthritis and healthy vaccine recipients
null, null;Isaacs, John D.;Brockbank, Sarah;Pedersen, Ayako Wakatsuki;Hilkens, Catharien;Anderson, Amy;Stocks, Philip;Lendrem, Dennis;Tarn, Jessica;Smith, Graham R.;Allen, Ben;Casement, John;Diboll, Julie;Harry, Rachel;Cooles, Faye A. H.;Cope, Andrew P.;Simpson, Gemma;Toward, Ruth;Noble, Hayley;Parke, Angela;Wu, Wing;Clarke, Fiona;Scott, David;Scott, Ian C.;Galloway, James;Lempp, Heidi;Ibrahim, Fowzia;Schwank, Samana;Molyneux, Gemma;Lazarov, Tomi;Geissmann, Frederic;Goodyear, Carl S.;McInnes, Iain B.;Donnelly, Iona;Gilmour, Ashley;Virlan, Aysin Tulunay;Porter, Duncan;Ponchel, Frederique;Emery, Paul;El-Jawhari, Jehan;Parmar, Rekha;McDermott, Michael F.;Fisher, Benjamin A.;Young, Steve P.;Jones, Philip;Raza, Karim;Filer, Andrew;Pitzalis, Costantino;Barnes, Michael R.;Watson, David S.;Henkin, Rafael;Thorborn, Georgina;Fossati-Jimack, Liliane;Kelly, Stephen;Humby, Frances;Bombardieri, Michele;Rana, Sharmila;Jia, Zhilong;Goldmann, Katriona;Lewis, Myles;Ng, Sandra;Barbosa-Silva, Adriano;Tzanis, Evan;Gallagher-Syed, Amaya;John, Christopher R.;Ehrenstein, Michael R.;Altobelli, Gioia;Martins, Sandra;Nguyen, Dao;Ali, Humayara;Ciurtin, Coziana;Buch, Maya;Symmons, Deborah;Worthington, Jane;Bruce, Ian N.;Sergeant, Jamie C.;Verstappen, Suzanne M. M.;Stirling, Fiona;Hughes-Morley, Adwoa;Tom, Brian;Farewell, Vernon;Zhong, Yujie;Taylor, Peter C.;Buckley, Christopher D.;Keidel, Sarah;Cuff, Carolyn;Levesque, Marc;Long, Andrew;Liu, Zheng;Lipsky, Samantha;Harvey, Bohdan;Macoritto, Michael;Hong, Feng;Kaymakcalan, Sukru;Tsuji, Wayne;Sabin, Tony;Ward, Neil;Talbot, Susan;Padhji, Desmond;Sleeman, Matthew;Finch, Donna;Herath, Athula;Lindholm, Catharina;Jenkins, Martin;Ho, Meilien;Hollis, Sally;Marshall, Chris;Parker, Gerry;Page, Matt;Edwards, Hannah;Cuza, Alexandru;Gozzard, Neil;Pandis, Ioannis;Rowe, Anthony;Capdevila, Francisco Bonachela;Loza, Matthew J.;Curran, Mark;Verbeeck, Denny;Dan Baker, null;Mela, Christopher M.;Vranic, Ivana;Mela, Catherine T.;Wright, Stephen;Rowell, Lucy;Vernon, Emma;Joseph, Nina;Payne, Neil;Rao, Ravi;Binks, Michael;Belson, Alexandra;Ludbrook, Valerie;Hicks, Kirsty;Tipney, Hannah;Ellis, Joanne;Hasan, Samiul;Didierlaurent, Arnaud;Burny, Wivine;Haynes, Andrea;Larminie, Chris;Harris, Ray;Dastros-Pitei, Daniela;Carini, Claudio;Kola, Blerina;Jelinsky, Scott;Hodge, Martin;Maciejewski, Mateusz;Ziemek, Daniel;Schulz-Knappe, Peter;Zucht, Hans-Dieter;Budde, Petra;Coles, Mark;Butler, James A.;Read, Simon
2022-01-01
Abstract
Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic inflammatory disorder with poorly defined aetiology characterised by synovial inflammation with variable disease severity and drug responsiveness. To investigate the peripheral blood immune cell landscape of early, drug naive RA, we performed comprehensive clinical and molecular profiling of 267 RA patients and 52 healthy vaccine recipients for up to 18 months to establish a high quality sample biobank including plasma, serum, peripheral blood cells, urine, genomic DNA, RNA from whole blood, lymphocyte and monocyte subsets. We have performed extensive multi-omic immune phenotyping, including genomic, metabolomic, proteomic, transcriptomic and autoantibody profiling. We anticipate that these detailed clinical and molecular data will serve as a fundamental resource offering insights into immune-mediated disease pathogenesis, progression and therapeutic response, ultimately contributing to the development and application of targeted therapies for RA.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.